يمثل قسم الجيولوجيا أحد الأقسام الرئيسية بكلية العلوم حيث أنشئ مع نشأة الكلية عام 1975 ويهدف إلي إعداد أجيال من الدارسين و الباحثين في مجالات علم الجيولوجيا المختلفة والتي تتطلبها احتياجات سوق العمل كما يقوم القسم بدور هام وفعال في تنمية المناطق الصحراوية بمحافظة سوهاج والمحافظات المجاورة من خلال تقديم العديد من الاستشارات والدراسات العلمية والفنية للجهات التنفيذية المختلفة.

 ويهدف القسم إلى إعداد الطالب للعمل في مختلف مجالات الجيولوجيا والمشاركة بنشاط في البحث العلمي وخدمة المجتمع. وهناك ثلاثة برامج أكاديمية، وقد أعدت لائحة جديدة لتقديم برنامج جديد للجيولوجيا الهندسية والبيئية. وتم اعداد برنامجا لدرجة الماجستير في إدارة الموارد المائية وبالتعاون مع جامعتي أسيوط وعين شمس وجامعة اكسترببريطانيا و جامعة مارتن لوثر الالمانية، وهيئة الاستشعار عن بعد وشركة ريجوا وذلك بتمويل من الاتحاد الأوروبي (التمبس).